Az egészségügyről szóló 21 lépés 12. pontjában leírtaknak megfelelően készült el 72 új szakmai irányelv, protokoll és módszertani levél. A szakmai irányelvek, a diagnosztikus és terápiás protokollok meghatározott egészségügyi problémával kapcsolatos rendszerezett, tudományos módszertannal kifejlesztett, és a lehető legjobb tudományos bizonyítékokon alapuló ajánlások, amelyek célja, hogy segítse a gyógyító orvost, a beteget, és a szakmapolitikai döntéshozókat a legmagasabb színvonalú és leghatékonyabb ellátások kiválasztásában, az országosan egységes színvonalú egészségügyi ellátás kialakításában.
Az egészségügyről szóló 1997. évi törvény szerint az egészségügyi ellátás során különösen érvényesülni kell a tudomány mindenkori állását tükröző és bizonyítékokon alapuló szakmai irányelvek, módszertani levelek ajánlásainak.
Ennek megfelelően az egészségügyben használt diagnosztikus, terápiás eljárások, beavatkozások, egyéb ellátások jelentős részéhez el kell készüljenek a nemzetközileg is elfogadható és országosan egységes színvonalú egészségügyi ellátást biztosító irányelvek, protokollok vagy módszertani levelek.
Az egészségügyi ellátások minőségében és szakmai tartalmában, hatékonyságában, hozzáférésében nagyok az eltérések és ezek az eltérések szakmai okokkal nem mindig indokolhatók. A nemzetközi gyakorlathoz képest a magyar egészségügyben eddig még alacsony az irányelvek, protokollok szerinti működés aránya – az IBR-modellkísérletben jól lehetett látni ennek hátrányát.
Az irányelvek, protokollok megjelentetésének eredményeképpen értékelhetővé válik az egészségügyi ellátás minősége, csökkennek a területi és intézményenkénti különbségek.
További pozitív hatás, hogy figyelembe vételük alapján csökkenthető az indokolatlan orvosi beavatkozások száma. Az adott beavatkozás pedig abban az intézményben történik, ahol a beteg számára az ellátás szakmailag biztonságosan valósulhat meg.
A megjelentetett irányelvek, protokollok alkalmazása az egészségügyi személyzet döntésén alapul, mindig az adott beteg állapotának, szükségleteinek és preferenciáinak a figyelembe vételével.
Az irányelveket, protokollokat 3 évente a minisztérium szakértők közreműködésével aktualizálja. A módosításhoz figyelembe veszi az irányelv, protokoll gyakorlati alkalmazhatóságát, a szakmai javaslatokat, valamint a betegek érdekvédelmében történt jelzéseket.
A szakmai irányelvek, protokollok kidolgozásának célja az is, hogy a hazai irányelvet, protokollt fejlesztő vagy nemzetközi irányelvek hazai adaptálását végző munkacsoportok számára egységesen meghatározza a fejlesztés/adaptálás folyamatának lépéseit, a résztvevők hatás- és felelősségi körét, illetve a közzététel kritériumait.
A tudományos bizonyítékokon alapuló diagnosztikus és terápiás irányelvekben, protokollokban foglaltak betartása jelentheti az elvárható általános szakmai követelményeket, melyek nélkül az elégtelen ellátások, műhibák, az ellátások közötti indokolatlan különbségek objektíven nem ítélhetők meg.

